1、化肥中不含有(yǒu)機質、腐殖質，因此大(dà)量使用化肥，土壤由于有(yǒu)機質和(hé)腐殖質的缺乏，土壤團粒結構遭到破壞，造成土壤闆結，農植物産量下降。
2、化肥利用率低(dī)，氮肥因為(wèi)易揮發、流失，利用率隻有(yǒu)30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因為(wèi)磷酸根化學活性活潑，施入土壤後大(dà)部分磷與土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等陽離子結合形成難溶性磷肥。鉀的利用率也隻有(yǒu)50%左右。
3、化肥大(dà)量使用使蔬菜瓜果品質大(dà)大(dà)下降。由于作(zuò)物不僅僅需要氮磷鉀，同時(shí)還(hái)需要鈣鐵(tiě)鋅硒等許多(duō)微量元素，而化肥一般成分比較單一，所以長期使用化肥必然導緻土壤中所含養分趨于單一，易使作(zuò)物營養失調，從而導緻作(zuò)物內(nèi)部轉化合成受阻，必然導緻作(zuò)物品質下降，瓜不甜，菜不香。
4、危害人(rén)體(tǐ)健康。大(dà)量施用化肥，易使蔬菜中硝酸鹽含量超标，而亞硝酸鹽與胺類物質結合形成N-亞硝酸基化合物為(wèi)強緻癌物質。
5、化肥的大(dà)量使用，還(hái)造成土壤的有(yǒu)益菌、蚯蚓的大(dà)量死亡。
6、化肥的長期低(dī)效施用，往往造成土壤中某些(xiē)元素的過分積累和(hé)土壤理(lǐ)化性質的變化及環境的污染。
7、從中國大(dà)量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依賴化肥，由此形成惡性循環。
1、改良土壤
(1)通(tōng)過有(yǒu)益菌的大(dà)量繁殖，大(dà)量有(yǒu)益菌在植物的根系周圍形成了優勢種群，抑制(zhì)了其他有(yǒu)害菌的生(shēng)命活動。
(2)快速分解土壤有(yǒu)機物質，促進土壤團粒的形成，且通(tōng)過有(yǒu)益菌的活動能夠疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水(shuǐ)、供水(shuǐ)及透氣性都得(de)到很(hěn)好的調節。
(3)分解土壤中的農藥殘留，避免殘留農藥對下季作(zuò)物産生(shēng)藥害。還(hái)對植物生(shēng)長過程通(tōng)過根系排放的有(yǒu)害物質進行(xíng)分解。
2、固氮、解磷、解鉀功能
能夠部分利用空(kōng)氣中的氮，通(tōng)過有(yǒu)益菌生(shēng)長代謝産生(shēng)相應的酶和(hé)酸，可(kě)對土壤中難溶性的磷、鉀肥(土壤中難溶性磷肥占95%，難溶性鉀占98%)進行(xíng)分解，從而成為(wèi)植物所能吸收的磷鉀肥。因此能夠大(dà)大(dà)提高(gāo)作(zuò)物對肥料的利用率，從而減少(shǎo)肥料的施用。＇
3、提高(gāo)作(zuò)物品質
解磷、解鉀的同時(shí)，能夠促使土壤中微量元素的釋放，被作(zuò)物所利用，同時(shí)有(yǒu)益菌代謝産生(shēng)多(duō)種植物所需的物質，如小(xiǎo)分子氨基酸、生(shēng)長刺激物質、維生(shēng)素等。
4、達到生(shēng)物防治病害的效果，灌根可(kě)抑制(zhì)土壤中的病菌，噴到葉面，可(kě)防止病害的入侵。
5、促進作(zuò)物早熟和(hé)延長采收期。由于土壤理(lǐ)化性質得(de)到改善，土壤養分豐富且平衡，土壤中肥料能夠更好的被作(zuò)物很(hěn)好的吸收，因此能夠促進作(zuò)物早熟和(hé)延長采收期。
6、和(hé)有(yǒu)機肥配合使用，能夠持續不斷的改良土壤，2-3年就可(kě)使土壤完全達到生(shēng)産有(yǒu)機作(zuò)物的标準，且因為(wèi)有(yǒu)益菌能夠快速分解有(yǒu)機物質為(wèi)作(zuò)物吸收，所以克服了有(yǒu)機肥料肥效慢的特點，單施有(yǒu)機肥産量低(dī)的特點。
7、生(shēng)物菌肥不像化肥那(nà)樣，一次性将過量的可(kě)溶性營養元素帶入土壤，生(shēng)物菌肥可(kě)避免環境污染，且有(yǒu)益菌不斷的在植物根系周圍不斷的繁殖代謝，持續地、非過量的向作(zuò)物提供營養。
